Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ATP7BP35670 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP7BP35670 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms