Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXA10P31260 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms