Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms