Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
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PTPRMP28827 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
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PTPRMP28827 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
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PTPRMP28827 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
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