Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDE4AP27815 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4AP27815 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
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