Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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PTPRBP23467 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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PTPRBP23467 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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PTPRBP23467 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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PTPRBP23467 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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PTPRBP23467 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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PTPRBP23467 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
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PTPRBP23467 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRBP23467 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRBP23467 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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