Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC3P19447 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms