Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD58P19256 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD58P19256 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD58P19256 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD58P19256 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD58P19256 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD58P19256 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD58P19256 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD58P19256 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD58P19256 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD58P19256 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD58P19256 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD58P19256 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD58P19256 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD58P19256 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD58P19256 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD58P19256 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD58P19256 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD58P19256 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD58P19256 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD58P19256 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD58P19256 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD58P19256 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD58P19256 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD58P19256 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD58P19256 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD58P19256 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD58P19256 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CD58P19256 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD58P19256 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD58P19256 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD58P19256 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD58P19256 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CD58P19256 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CD58P19256 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD58P19256 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD58P19256 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD58P19256 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD58P19256 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD58P19256 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD58P19256 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD58P19256 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD58P19256 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD58P19256 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD58P19256 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD58P19256 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD58P19256 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CD58P19256 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD58P19256 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD58P19256 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD58P19256 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD58P19256 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD58P19256 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD58P19256 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD58P19256 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CD58P19256 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD58P19256 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD58P19256 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD58P19256 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD58P19256 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD58P19256 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD58P19256 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD58P19256 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD58P19256 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD58P19256 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD58P19256 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CD58P19256 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD58P19256 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD58P19256 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD58P19256 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD58P19256 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD58P19256 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CD58P19256 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD58P19256 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD58P19256 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD58P19256 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD58P19256 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD58P19256 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD58P19256 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD58P19256 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD58P19256 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD58P19256 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD58P19256 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD58P19256 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD58P19256 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD58P19256 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD58P19256 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD58P19256 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD58P19256 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD58P19256 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD58P19256 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD58P19256 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD58P19256 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CD58P19256 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CD58P19256 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD58P19256 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CD58P19256 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CD58P19256 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CD58P19256 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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