Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIG1P18858 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIG1P18858 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIG1P18858 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIG1P18858 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIG1P18858 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIG1P18858 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LIG1P18858 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIG1P18858 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LIG1P18858 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIG1P18858 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LIG1P18858 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIG1P18858 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIG1P18858 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LIG1P18858 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIG1P18858 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIG1P18858 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIG1P18858 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIG1P18858 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIG1P18858 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIG1P18858 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIG1P18858 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIG1P18858 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIG1P18858 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIG1P18858 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIG1P18858 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIG1P18858 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIG1P18858 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIG1P18858 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIG1P18858 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIG1P18858 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIG1P18858 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIG1P18858 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIG1P18858 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIG1P18858 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIG1P18858 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIG1P18858 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIG1P18858 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIG1P18858 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIG1P18858 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIG1P18858 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIG1P18858 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIG1P18858 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIG1P18858 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIG1P18858 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIG1P18858 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIG1P18858 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIG1P18858 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIG1P18858 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIG1P18858 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIG1P18858 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIG1P18858 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIG1P18858 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIG1P18858 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIG1P18858 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIG1P18858 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIG1P18858 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIG1P18858 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIG1P18858 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIG1P18858 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIG1P18858 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIG1P18858 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIG1P18858 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIG1P18858 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIG1P18858 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIG1P18858 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIG1P18858 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIG1P18858 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIG1P18858 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LIG1P18858 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIG1P18858 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIG1P18858 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIG1P18858 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIG1P18858 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LIG1P18858 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIG1P18858 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIG1P18858 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIG1P18858 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIG1P18858 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIG1P18858 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIG1P18858 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIG1P18858 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIG1P18858 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIG1P18858 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIG1P18858 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIG1P18858 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIG1P18858 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIG1P18858 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LIG1P18858 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LIG1P18858 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIG1P18858 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIG1P18858 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIG1P18858 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LIG1P18858 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIG1P18858 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LIG1P18858 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LIG1P18858 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIG1P18858 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIG1P18858 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIG1P18858 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms