Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD1P17405 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms