Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD46P15529 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD46P15529 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD46P15529 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD46P15529 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD46P15529 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD46P15529 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD46P15529 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CD46P15529 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD46P15529 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD46P15529 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD46P15529 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD46P15529 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD46P15529 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD46P15529 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CD46P15529 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD46P15529 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD46P15529 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD46P15529 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CD46P15529 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD46P15529 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD46P15529 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD46P15529 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD46P15529 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD46P15529 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD46P15529 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD46P15529 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD46P15529 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD46P15529 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD46P15529 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD46P15529 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD46P15529 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD46P15529 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD46P15529 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CD46P15529 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD46P15529 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD46P15529 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CD46P15529 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD46P15529 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD46P15529 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD46P15529 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CD46P15529 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD46P15529 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD46P15529 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD46P15529 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD46P15529 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD46P15529 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD46P15529 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CD46P15529 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD46P15529 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD46P15529 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD46P15529 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD46P15529 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD46P15529 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD46P15529 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD46P15529 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD46P15529 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD46P15529 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD46P15529 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD46P15529 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD46P15529 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD46P15529 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD46P15529 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD46P15529 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD46P15529 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD46P15529 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD46P15529 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD46P15529 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD46P15529 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD46P15529 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD46P15529 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD46P15529 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD46P15529 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD46P15529 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CD46P15529 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD46P15529 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD46P15529 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD46P15529 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD46P15529 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD46P15529 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD46P15529 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD46P15529 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD46P15529 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD46P15529 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD46P15529 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD46P15529 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD46P15529 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CD46P15529 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD46P15529 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD46P15529 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD46P15529 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD46P15529 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD46P15529 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CD46P15529 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CD46P15529 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD46P15529 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD46P15529 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD46P15529 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD46P15529 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD46P15529 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms