Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD28P10747 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD28P10747 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD28P10747 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD28P10747 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD28P10747 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD28P10747 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD28P10747 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD28P10747 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD28P10747 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD28P10747 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD28P10747 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD28P10747 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD28P10747 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD28P10747 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD28P10747 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD28P10747 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD28P10747 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD28P10747 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD28P10747 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD28P10747 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD28P10747 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD28P10747 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD28P10747 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD28P10747 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD28P10747 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD28P10747 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD28P10747 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD28P10747 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD28P10747 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD28P10747 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD28P10747 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD28P10747 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD28P10747 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD28P10747 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD28P10747 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD28P10747 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD28P10747 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD28P10747 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD28P10747 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD28P10747 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD28P10747 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD28P10747 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD28P10747 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD28P10747 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD28P10747 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD28P10747 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD28P10747 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD28P10747 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD28P10747 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD28P10747 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD28P10747 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD28P10747 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD28P10747 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD28P10747 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD28P10747 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD28P10747 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD28P10747 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD28P10747 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD28P10747 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD28P10747 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD28P10747 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD28P10747 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD28P10747 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD28P10747 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD28P10747 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD28P10747 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD28P10747 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD28P10747 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD28P10747 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD28P10747 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD28P10747 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD28P10747 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD28P10747 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD28P10747 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD28P10747 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD28P10747 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD28P10747 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD28P10747 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD28P10747 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD28P10747 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD28P10747 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD28P10747 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD28P10747 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD28P10747 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD28P10747 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD28P10747 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD28P10747 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD28P10747 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD28P10747 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD28P10747 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD28P10747 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD28P10747 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD28P10747 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD28P10747 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD28P10747 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD28P10747 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD28P10747 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD28P10747 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD28P10747 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms