Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms