Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms