Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXB7P09629 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms