Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM2O94769 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM2O94769 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM2O94769 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM2O94769 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM2O94769 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM2O94769 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM2O94769 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM2O94769 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM2O94769 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM2O94769 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM2O94769 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM2O94769 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM2O94769 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM2O94769 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM2O94769 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM2O94769 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM2O94769 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM2O94769 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM2O94769 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM2O94769 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM2O94769 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM2O94769 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM2O94769 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM2O94769 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM2O94769 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM2O94769 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM2O94769 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM2O94769 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM2O94769 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM2O94769 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM2O94769 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM2O94769 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM2O94769 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM2O94769 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM2O94769 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM2O94769 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM2O94769 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM2O94769 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM2O94769 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM2O94769 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM2O94769 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM2O94769 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM2O94769 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM2O94769 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM2O94769 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM2O94769 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM2O94769 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM2O94769 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM2O94769 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM2O94769 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM2O94769 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM2O94769 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM2O94769 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM2O94769 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM2O94769 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM2O94769 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM2O94769 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM2O94769 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM2O94769 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM2O94769 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM2O94769 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM2O94769 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM2O94769 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM2O94769 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM2O94769 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM2O94769 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM2O94769 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM2O94769 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM2O94769 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM2O94769 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM2O94769 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM2O94769 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM2O94769 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM2O94769 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM2O94769 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM2O94769 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM2O94769 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM2O94769 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM2O94769 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM2O94769 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM2O94769 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM2O94769 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM2O94769 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM2O94769 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM2O94769 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM2O94769 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM2O94769 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM2O94769 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM2O94769 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM2O94769 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM2O94769 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM2O94769 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM2O94769 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM2O94769 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM2O94769 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM2O94769 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM2O94769 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM2O94769 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM2O94769 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms