Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TIMM17BO60830 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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