Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPLO60437 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPLO60437 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPLO60437 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPLO60437 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPLO60437 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPLO60437 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPLO60437 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPLO60437 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PPLO60437 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPLO60437 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPLO60437 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPLO60437 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPLO60437 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPLO60437 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPLO60437 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPLO60437 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPLO60437 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPLO60437 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPLO60437 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPLO60437 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPLO60437 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PPLO60437 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PPLO60437 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPLO60437 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPLO60437 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPLO60437 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPLO60437 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPLO60437 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPLO60437 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPLO60437 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPLO60437 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPLO60437 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPLO60437 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPLO60437 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPLO60437 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPLO60437 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PPLO60437 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPLO60437 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPLO60437 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPLO60437 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPLO60437 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPLO60437 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPLO60437 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPLO60437 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPLO60437 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPLO60437 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PPLO60437 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPLO60437 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPLO60437 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PPLO60437 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPLO60437 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPLO60437 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPLO60437 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPLO60437 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPLO60437 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPLO60437 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPLO60437 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPLO60437 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPLO60437 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPLO60437 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPLO60437 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPLO60437 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPLO60437 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPLO60437 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPLO60437 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPLO60437 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPLO60437 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPLO60437 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPLO60437 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPLO60437 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPLO60437 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPLO60437 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPLO60437 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPLO60437 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPLO60437 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPLO60437 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPLO60437 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPLO60437 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPLO60437 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPLO60437 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPLO60437 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PPLO60437 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPLO60437 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPLO60437 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPLO60437 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPLO60437 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPLO60437 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPLO60437 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPLO60437 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPLO60437 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PPLO60437 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPLO60437 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPLO60437 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PPLO60437 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PPLO60437 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PPLO60437 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPLO60437 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPLO60437 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPLO60437 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms