Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX16O60231 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX16O60231 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX16O60231 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX16O60231 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX16O60231 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX16O60231 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX16O60231 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX16O60231 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX16O60231 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX16O60231 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX16O60231 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX16O60231 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX16O60231 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX16O60231 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX16O60231 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX16O60231 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX16O60231 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX16O60231 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX16O60231 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX16O60231 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX16O60231 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX16O60231 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX16O60231 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX16O60231 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX16O60231 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX16O60231 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX16O60231 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX16O60231 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX16O60231 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX16O60231 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX16O60231 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX16O60231 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX16O60231 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX16O60231 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX16O60231 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX16O60231 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX16O60231 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX16O60231 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX16O60231 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX16O60231 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX16O60231 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX16O60231 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX16O60231 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX16O60231 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX16O60231 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX16O60231 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX16O60231 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
DHX16O60231 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHX16O60231 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHX16O60231 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHX16O60231 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHX16O60231 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHX16O60231 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHX16O60231 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHX16O60231 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHX16O60231 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHX16O60231 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHX16O60231 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHX16O60231 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHX16O60231 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHX16O60231 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHX16O60231 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHX16O60231 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHX16O60231 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHX16O60231 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHX16O60231 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX16O60231 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX16O60231 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX16O60231 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX16O60231 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX16O60231 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX16O60231 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX16O60231 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX16O60231 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX16O60231 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX16O60231 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX16O60231 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX16O60231 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX16O60231 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX16O60231 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX16O60231 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX16O60231 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX16O60231 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX16O60231 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX16O60231 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX16O60231 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX16O60231 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX16O60231 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX16O60231 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX16O60231 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX16O60231 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX16O60231 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX16O60231 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DHX16O60231 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DHX16O60231 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DHX16O60231 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DHX16O60231 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DHX16O60231 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DHX16O60231 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms