Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms