Protein–RNA interactions for Protein: O43745

CHP2, Calcineurin B homologous protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP2O43745 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHP2O43745 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHP2O43745 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHP2O43745 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHP2O43745 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHP2O43745 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHP2O43745 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHP2O43745 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHP2O43745 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHP2O43745 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHP2O43745 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHP2O43745 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHP2O43745 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHP2O43745 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHP2O43745 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHP2O43745 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHP2O43745 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHP2O43745 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHP2O43745 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHP2O43745 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHP2O43745 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHP2O43745 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHP2O43745 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHP2O43745 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHP2O43745 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHP2O43745 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHP2O43745 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHP2O43745 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHP2O43745 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHP2O43745 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHP2O43745 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHP2O43745 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHP2O43745 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHP2O43745 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHP2O43745 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHP2O43745 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHP2O43745 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHP2O43745 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHP2O43745 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHP2O43745 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHP2O43745 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHP2O43745 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHP2O43745 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHP2O43745 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHP2O43745 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHP2O43745 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHP2O43745 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHP2O43745 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHP2O43745 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHP2O43745 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHP2O43745 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHP2O43745 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHP2O43745 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHP2O43745 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHP2O43745 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHP2O43745 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHP2O43745 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHP2O43745 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHP2O43745 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHP2O43745 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHP2O43745 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHP2O43745 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHP2O43745 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHP2O43745 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHP2O43745 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHP2O43745 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHP2O43745 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHP2O43745 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHP2O43745 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHP2O43745 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHP2O43745 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHP2O43745 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHP2O43745 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHP2O43745 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHP2O43745 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP2O43745 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP2O43745 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP2O43745 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP2O43745 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP2O43745 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP2O43745 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP2O43745 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP2O43745 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP2O43745 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP2O43745 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP2O43745 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP2O43745 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP2O43745 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP2O43745 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP2O43745 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP2O43745 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP2O43745 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP2O43745 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP2O43745 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP2O43745 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP2O43745 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP2O43745 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP2O43745 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP2O43745 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHP2O43745 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms