Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms