Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTSS1O43312 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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