Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRODHO43272 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRODHO43272 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRODHO43272 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PRODHO43272 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRODHO43272 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRODHO43272 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRODHO43272 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRODHO43272 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRODHO43272 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRODHO43272 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRODHO43272 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRODHO43272 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRODHO43272 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRODHO43272 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRODHO43272 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRODHO43272 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRODHO43272 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRODHO43272 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRODHO43272 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRODHO43272 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRODHO43272 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRODHO43272 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRODHO43272 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRODHO43272 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRODHO43272 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRODHO43272 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRODHO43272 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRODHO43272 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRODHO43272 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRODHO43272 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRODHO43272 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRODHO43272 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRODHO43272 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRODHO43272 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRODHO43272 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRODHO43272 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRODHO43272 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRODHO43272 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRODHO43272 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRODHO43272 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRODHO43272 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRODHO43272 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRODHO43272 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRODHO43272 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRODHO43272 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRODHO43272 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRODHO43272 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRODHO43272 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRODHO43272 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRODHO43272 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRODHO43272 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRODHO43272 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRODHO43272 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRODHO43272 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRODHO43272 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRODHO43272 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRODHO43272 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRODHO43272 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRODHO43272 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRODHO43272 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRODHO43272 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRODHO43272 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRODHO43272 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRODHO43272 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRODHO43272 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRODHO43272 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRODHO43272 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms