Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
EBAG9O00559 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms