Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TULP1O00294 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TULP1O00294 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TULP1O00294 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TULP1O00294 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TULP1O00294 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TULP1O00294 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TULP1O00294 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TULP1O00294 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TULP1O00294 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TULP1O00294 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TULP1O00294 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TULP1O00294 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TULP1O00294 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TULP1O00294 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TULP1O00294 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TULP1O00294 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TULP1O00294 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TULP1O00294 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TULP1O00294 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TULP1O00294 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TULP1O00294 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TULP1O00294 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TULP1O00294 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TULP1O00294 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TULP1O00294 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TULP1O00294 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TULP1O00294 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TULP1O00294 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TULP1O00294 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TULP1O00294 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TULP1O00294 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TULP1O00294 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TULP1O00294 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TULP1O00294 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TULP1O00294 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TULP1O00294 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TULP1O00294 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TULP1O00294 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TULP1O00294 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TULP1O00294 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TULP1O00294 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TULP1O00294 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TULP1O00294 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TULP1O00294 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TULP1O00294 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TULP1O00294 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TULP1O00294 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TULP1O00294 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TULP1O00294 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TULP1O00294 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TULP1O00294 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TULP1O00294 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TULP1O00294 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TULP1O00294 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TULP1O00294 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TULP1O00294 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TULP1O00294 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TULP1O00294 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TULP1O00294 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TULP1O00294 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TULP1O00294 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TULP1O00294 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TULP1O00294 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TULP1O00294 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TULP1O00294 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TULP1O00294 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TULP1O00294 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TULP1O00294 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TULP1O00294 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TULP1O00294 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TULP1O00294 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TULP1O00294 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TULP1O00294 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TULP1O00294 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TULP1O00294 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TULP1O00294 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TULP1O00294 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TULP1O00294 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TULP1O00294 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TULP1O00294 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TULP1O00294 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TULP1O00294 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TULP1O00294 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TULP1O00294 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TULP1O00294 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TULP1O00294 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TULP1O00294 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TULP1O00294 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TULP1O00294 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TULP1O00294 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TULP1O00294 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TULP1O00294 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TULP1O00294 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TULP1O00294 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TULP1O00294 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TULP1O00294 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TULP1O00294 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TULP1O00294 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TULP1O00294 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms