Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP23O00161 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms