Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPB9F8W1W9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms