Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms