Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERINC4A6NH21 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms