Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms