Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms