Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms