Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms