Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMB4A4D0S4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms