Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD3A2A2Y4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD3A2A2Y4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms