Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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