Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms