Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 292.8 ms