Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 LNX1-202ENST00000306888 3757 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 LINC00559-201ENST00000569476 3867 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 SPRY1-201ENST00000339241 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 PSG6-201ENST00000187910 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 ARHGEF3-214ENST00000497267 2197 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 AL049651.2-202ENST00000419734 412 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 FDPSP1-201ENST00000424976 1071 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 AP001048.1-201ENST00000436359 280 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 RPL29P7-201ENST00000440227 457 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 CYCSP44-201ENST00000448560 313 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 ZNF286A-205ENST00000472486 827 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 AC023908.2-201ENST00000558616 318 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 AC099314.1-201ENST00000563916 562 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 SNX29P2-204ENST00000603801 875 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 HNRNPA1P67-201ENST00000604027 926 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 AC024085.1-201ENST00000604299 432 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 HNF4A-AS1-202ENST00000609152 413 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 PTCHD3P1-201ENST00000612350 537 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 HOTTIP_2.1-201ENST00000616633 376 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 ZNF331-203ENST00000449416 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 AC091544.5-201ENST00000620192 3815 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 LINC00310-204ENST00000430922 2086 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 SRFBP1-201ENST00000339397 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 LEKR1-204ENST00000470811 2881 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 FAM205C-201ENST00000340783 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 C1D-203ENST00000409302 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 AC134879.1-201ENST00000426062 394 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 LINC01525-201ENST00000442182 511 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 AC083864.2-201ENST00000446024 482 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 AC011333.1-201ENST00000520587 436 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 LYZ-202ENST00000548839 558 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 AC126177.6-201ENST00000550420 1009 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 AC053481.5-201ENST00000602932 397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 FAM205C-203ENST00000603640 1017 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 AC244196.1-201ENST00000620569 409 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 AC078909.2-201ENST00000620584 398 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
BHMTQ93088 LAMTOR5-AS1-248ENST00000630488 703 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms