Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 CASC19-212ENST00000641153 1287 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 ADGRE4P-202ENST00000600751 2810 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 GPD2-203ENST00000409674 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 PLA2G7-202ENST00000537365 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 SCIN-201ENST00000297029 9713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 SNORD91A-202ENST00000609620 191 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 GLRA3-201ENST00000274093 8770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 AL451064.2-201ENST00000623514 1654 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEDD1Q8NHV4 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms