Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 MCF2L-206ENST00000397021 576 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CEBPZOS-202ENST00000397064 568 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 GEMIN6-203ENST00000409566 834 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC097059.2-201ENST00000414039 592 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 LINC00222-203ENST00000416890 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 IFIT6P-201ENST00000418257 1194 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 SLC25A5P4-201ENST00000418448 869 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC064862.1-201ENST00000421221 201 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RPL36P2-201ENST00000426026 315 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL121983.2-204ENST00000430592 448 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 WBP1LP7-201ENST00000437905 363 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 LINC00518-202ENST00000479822 906 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC093270.1-201ENST00000482584 486 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 SMIM20-202ENST00000514384 774 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 KRT18P59-201ENST00000524879 1231 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC116456.1-202ENST00000528151 597 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 GPHA2-203ENST00000533257 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 DAZAP2-210ENST00000551313 587 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 KRT18P47-201ENST00000561341 977 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC009108.2-201ENST00000566485 269 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC130343.1-201ENST00000576540 459 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC005324.1-203ENST00000580194 541 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC008649.2-201ENST00000585999 242 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ZNF675-202ENST00000596211 581 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC243960.3-201ENST00000599316 580 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 PCAT14-203ENST00000629869 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CTNND1-230ENST00000532245 5655 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC008074.3-201ENST00000561559 1907 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CEP57L1-202ENST00000368968 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CNTN4-AS1-201ENST00000442749 1640 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 GPM6A-221ENST00000515090 1500 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 FBXO3-209ENST00000531080 1448 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 NFIB-205ENST00000380959 8198 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 SCGB2A1-201ENST00000244930 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.6 ms