Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 DMXL2-201ENST00000251076 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 VWA3A-202ENST00000389398 4600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 DOCK3-201ENST00000266037 8755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 BCOR-201ENST00000342274 6390 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 PIEZO2-210ENST00000580640 8334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 DRP2-202ENST00000395209 7277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 TTLL4-201ENST00000258398 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 DOCK8-209ENST00000469391 6386 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 GCC2-201ENST00000309863 7537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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LAMA3Q16787 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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LAMA3Q16787 KIAA1958-201ENST00000337530 11775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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LAMA3Q16787 TEX14-202ENST00000349033 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 MLYCD-201ENST00000262430 13038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 MYOM1-202ENST00000356443 5847 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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LAMA3Q16787 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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LAMA3Q16787 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 NRP1-206ENST00000374867 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 HERC2P3-204ENST00000426501 5995 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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