Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 NDUFB2-210ENST00000475276 539 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.3 ms