Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USF2Q15853 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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