Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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SIX1Q15475 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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