Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC010480.1-201ENST00000624823 684 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 SCIN-201ENST00000297029 9713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 EMX2OS-206ENST00000551288 7280 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 CC2D2A-204ENST00000503292 5175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 PPFIA2-201ENST00000333447 5517 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 ADGRL3-214ENST00000511324 5042 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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