Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms