Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 DCAF5-208ENST00000556847 2791 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 GINS1-201ENST00000262460 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AF127936.2-201ENST00000455253 1724 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 PDE4DIP-203ENST00000369349 4677 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 C14orf166-201ENST00000261700 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 SLC11A2-202ENST00000262052 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 PITRM1-AS1-201ENST00000430356 3998 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 CEP57-207ENST00000537677 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL590999.1-201ENST00000607675 3776 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 DLG2-218ENST00000524982 2872 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 STAT2-202ENST00000418572 1548 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 APOB-201ENST00000233242 14121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL353763.2-201ENST00000623489 1903 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC127459.1-201ENST00000563129 2768 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 SLC9A9-201ENST00000316549 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 SLC6A2-206ENST00000567238 3160 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 CLRN1-AS1-202ENST00000476886 2223 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 GCNT2-216ENST00000495262 2214 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 TTC26-202ENST00000430935 4198 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 TCL6-201ENST00000352367 3398 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 R3HCC1L-203ENST00000370584 3372 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 C1D-202ENST00000407324 1379 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 OPTN-203ENST00000378748 3521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 TLR1-202ENST00000502213 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 OR1G1-201ENST00000328890 998 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 NR1I3-203ENST00000367981 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RN7SKP127-201ENST00000410443 354 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC007091.1-201ENST00000412563 566 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC074117.1-203ENST00000412749 399 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC245014.1-201ENST00000427732 381 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC105052.2-201ENST00000434317 794 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 HGF-206ENST00000444829 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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CLN3Q13286 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 CHIAP1-201ENST00000456220 995 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RPS4XP19-201ENST00000460237 736 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC008620.1-201ENST00000468453 592 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 CSF2RA-217ENST00000494969 489 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AMTN-202ENST00000504451 761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 NR1I3-226ENST00000508740 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 LINC01094-206ENST00000514130 594 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 OR6M3P-201ENST00000531567 700 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC118757.1-202ENST00000589074 609 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RPS4XP16-202ENST00000595905 807 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC024580.1-201ENST00000623020 674 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL513321.2-202ENST00000634479 921 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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