Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TTPAP49638 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TTPAP49638 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TTPAP49638 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TTPAP49638 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TTPAP49638 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TTPAP49638 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TTPAP49638 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TTPAP49638 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC119674.1-217ENST00000641942 1086 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TTPAP49638 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TTPAP49638 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TTPAP49638 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TTPAP49638 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TTPAP49638 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TTPAP49638 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TTPAP49638 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TTPAP49638 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TTPAP49638 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 LINC01047-201ENST00000415193 778 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TTPAP49638 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms